卓越培养项目

医学院合成生物学制药团队介绍

编辑:系统管理员 发布时间:2020.06.12 阅读数:1479 来源:工程师学院


医学院合成生物学制药团队介绍【2023年版】

  本团队招生领域及研究方向:制药工程(台州研究院新药创制工程项目),项目研究方向:合成生物学制药工程,招生计划:5名。项目咨询联系人:谢志鹏,邮箱:xzp@zju.edu.cn

一.项目特点

2020年我国制药产业年产值逾3万亿,其中原料药出口全球第一,微生物制药(包括微生物源功能食品)产业近万亿。但微生物制药产业长期存在生产菌传代稳定性差、发酵水平低、同系物杂质多等问题,以及候选药物匮乏,缺乏新药研发动能。

合成生物学是生命科学和工程技术相结合形成的新兴生物技术,主要目标是人工设计和构建新的生物部件与装置,进而设计新的生物功能和体系,是改变医疗、制药、材料、食品等国民经济支柱产业的四大颠覆性技术之一。新冠病毒肺炎疫情过后,前沿技术将成为新一轮经济发展的引擎,合成生物学技术是新型生物产业发展的重要支撑技术。世界各国均投入巨资以提升其未来的科技竞争实力,我国已列入国家重要战略规划,十三五期间科技部启动了重点研发合成生物学专项。中美贸易战中合成生物学被美国列入不准技术出口的4大领域之一,合成生物学已成为全球前沿创新技术的战略高地和科技战的战略要塞。因此,发展药物合成生物学,创建菌株稳定、产物组分简单、发酵单位高的合成生物制药新模式,突破关键技术瓶颈,实现优质高产和新药创制,从而支撑我国微生物制药产业从大国转变成强国,具有重要战略意义。

浙江大学药物生物技术研究所/医学院微生物系含10位教授/研究员和一批副教授,其中浙大求是特聘教授1人、多层次计划入选者9人,近5年获批合成生物学相关的国家级项目或课题总共30项,总经费近5000万,包括国家重点研发计划合成生物学重点专项、国家自然科学基金重点项目、重大新药创制专项课题、创新特区合成生物学项目等标志性项目。

二.研究项目

1.药物合成生物体系重构与系统优化

2.植物源药物异源生物合成技术

3.药用基因资源挖掘技术

4.发酵过程智能控制技术

三.合作单位

浙江大学台州研究院。

四.专业实践

项目重点培养研究生作为未来工程师的基本能力,掌握微生物制药全过程的工程原理、一般方法和关键工艺控制点,具备实验设计、数据处理、结果分析、发现问题等独立的科学研究能力,以及项目实施及其过程协调能力。熟练掌握微生物药物基于合成生物体系对环境应答的工艺优化与中试放大技术,以及分离纯化工艺设计与优化技术等。

本项目专业实践模块设置了校内专业实践训练和企业实践训练两部分内容,校内专业实践训练让研究生在校内实验室完成;企业专业实践模块要求研究生在入学后至第2学年结束前在产教融合基地参加不少于3-6个月的专业实践训练,在企业导师指导下参与企业项目的技改工作或在企业车间轮岗实践,校外实践主要包括菌种制备、发酵罐发酵、药物提纯、精制、药物检验等药物原料的制备过程,熟悉和掌握药物生产的全过程。

五.就业前景

1)生物医药行业是朝阳产业

医药行业被称为“永不衰落的朝阳产业”。随着传统化学制药黄金时代的结束,新化学药品数量逐年下降,而生物制药成为当今活跃和发展最迅速的领域。随着基因组学和蛋白质组学研究的深入和合成生物学的突飞猛进,越来越多与人类疾病发展相关的靶标被确定,生物制药将有更多的机会获得突破性进展。目前全球正处于生物医药技术大规模产业化的开始阶段,目前正处于快速发展期,已然逐渐成为世界经济的主导产业之一。

2)生物医药行业亟需大量高级工程技术人才

作为人口大国的中国,从事生物技术产业研究与开发的人数仅为1.7万,生产和经营的人数为0.9万,仅相当于美国生物技术产业人数的1/4。近年来生物医药市场的快速发展造成企业对于生物制药专业人才的需求陡增,尤其处于生物制药产业前沿的医药工程高级技术人才更是严重不足,已成为制约我国生物医药产业发展的瓶颈。

3)项目顺应微生物制药产业的工程人才需求

2011年,教育部批准生物制药专业”成为战略性新兴产业专业。与传统的药学类专业及生物工程类专业相比,其发展具有不可替代性。然而,当前全国高校生物制药相关专业的科学学位研究生埋头于基础理论研究,忽视了市场和产业的技术需求和工程特征,导致学难以致用,研不能商用的窘境。

“药物合成生物学”项目培养的研究生,有效地弥补了上述科学学位研究生培养制度存在的缺陷。其培养环节几乎涉及生物制药的全过程,包括上游过程,即利用合成生物学技术改造获得高活性的微生物菌种,和下游过程,即优化和放大药物的微生物合成工艺,研发高收率、节能减排的药物分离提取工艺。

4)就业方向及薪酬

本项目毕业的研究生,其主要就业方向为国内外各生物制药企业,从事生物制药技术的应用研究或工业技术研究和应用。根据未止科技从某知名招聘网站抓取的近1个月、总计10万份招聘信息进行的分析结果,全国共有超过7000家生物制药企业发布了超过13万个招聘岗位,平均月薪为7550元,其中67%生物制药企业处于500人以下规模,平均月薪约9000元。另据职友集网站发布的报告显示,生物制药相关专业的应届毕业生的月薪为7500元,具有不同年限从业经验的、以及研究生以上学历的平均月薪在10000元以上。

在生物制药企业从事行业重大或前沿课题研究的,其学历要求至少硕士研究生以上,相应薪酬较高。比如,本项目主要参与企业丽珠集团新北江制药股份有限公司,其参与从事科技部合成生物学专项项目“放线菌药物合成生物体系的网络重构与系统优化”的研发人员,其平均月薪超过15000元。

本项目毕业的研究生,还可进入证券行业从事医药行业分析研究、进入新兴的互联网公司从事医药互联网产品开发和应用等,根据行业特点,其月薪15000元起步,且上难封顶。

六.合成生物学制药导师团队

李永泉教授领衔的医学院合成生物学制药团队由7名教授/研究员和一批博士后组成,长期从事微生物合成生物学与合成生物学制药研究,注重基础与技术链接、技术与产业互动,产学研特色鲜明。建有浙江省微生物生化与代谢工程重点实验室、浙江省微生物制药工程实验室。

团队坚守合成生物学制药研究方向15年,建立了以基因组重塑、合成途径重构、调控通路重组、生物合成过程智能控制为核心的放线菌合成生物体系重构技术,以及高版本底盘细胞构建与异源生物合成、隐性基因簇激活,形成了放线菌合成生物体系重构与系统优化的理论与关键技术体系,并开启探索合成生物学与人工智能融合技术,是我国合成生物学制药主要创新团队,在学术领域和制药产业界具有较好的影响力。

研究团队近年主持或完成了国家重点研发计划合成生物学重点专项、国家自然科学基金重点项目、国家新药创制重大专项课题、863合成生物技术重大专项课题、科技创新特区合成生物学项目等标志性项目,通过产学研合作主导完成了他克莫司、纳他霉素、达托霉素、L-酒石酸、SOD、溶菌酶、盐霉素等药物的研制或高产改造,支撑合作企业获多项新药证书,产生显著的社会经济效益;目前又开展了达巴万星、奥利万星、非达霉素等高端微生物药物的新药创制,进展顺利,可望实施产业应用。

七.导师简介

1. 李永泉教授

教授、博导,浙江大学求是特聘教授,享受国务院政府特殊津贴,是我国合成生物学领域的领军科学家之一。现任浙江大学药物生物技术研究所所长,浙江省微生物生化与代谢工程重点实验室主任、浙江省微生物制药技术工程实验室主任。浙江省微生物学会理事长、中国微生物学会理事兼分子微生物学专委会副主任、中国医药生物技术协会合成生物学分会常务理事、中国生物工程学会合成生物学专委会委员。

长期从事微生物合成生物学与合成生物学制药研究,系统解析了放线菌调控网络的分子机制,建立了生产菌基因组重塑、合成途径重构、调控网络重组等合成生物学关键技术,利用表观遗传学开展了放线菌隐性基因簇激活机制、合成生物体系鲁棒性等研究;通过产学研合作主导完成他克莫司、纳他霉素、达托霉素等微生物药物的研制或高产改造,支撑合作企业获多项新药证书。近年主持了国家重点研发合成生物学重点专项项目(首席科学家,批准号2019YFA090047)、国家自然科学基金重点项目、863合成生物技术重大专项课题、国家新药创制重大专项课题等项目,授权国家发明专利20项,获省部级科技进步奖一等奖2项、二等奖3项、中国石化联合会技术发明奖一等奖1项,以通讯作者在Nature CommunicationJournal of Biological ChemistryMolecular MicrobiologyApplied and Environmental Microbiology等领域主流杂志发表120余篇SCI论文。

A. 教育与工作经历

2016.1-                浙江大学药物生物技术研究所所长,教授、博导

2012.01-               浙江大学求是特聘教授、博导

2013.12-               浙江省微生物制药技术工程实验室主任

2009.12-      浙江省微生物生化与代谢工程重点实验室主任

2006.01-2015.12      浙江大学生物化学研究所所长,教授、博导

2002.12-2015.12      浙江大学生命科学学院教授、博导

2010.09-2010.11       美国康乃尔大学高级访问学者

2007.02-2007.03       美国威斯康星大学药学院高级访问学者

2001.05-2002.07       美国明尼苏达大学联培博士生/访问学者

1999.03-2003.06       浙江大学生物化工专业博士生

1998.09-2002.12       浙江大学生命科学学院副教授、硕导

1995.05-1998.01       浙江佐力药业有限公司总工程师

1992.04-1998.09       杭州大学生科院讲师、副教授,副所长

1989.09-1992.03       浙江大学生物化工专业硕士研究生

B.代表性SCI论文(限10篇)

在领域主流杂志上发表100余篇SCI论文,近5年主要SCI论文如下:

[1] Yuan-Yang Guo, Zhen-Hua Li, Tian-Yu Xia, Yi-Ling Du, Xu-Ming Mao*&Yong-Quan Li*Molecular mechanism of azoxy bond formation for azoxymycins biosynthesisNature Communication, 2019, 104420

[2] Shuai Luo, Xin‑Ai Chen, Xu‑Ming Mao*, Yong‑Quan Li*, Regulatory and biosynthetic effects of the bkd gene clusters on the production of daptomycin and its analogs A21978C1, Journal of Industrial Microbiology & Biotechnology, 2018, 45:271–279

[3] Xu-Ming Mao, Shuai Luo, Ri-Cheng Zhou, Feng Wang, Pin Yu, Ning Sun, Xiao-Xia Chen, Yi Tang and Yong-Quan Li*Transcriptional regulation of the daptomycin gene cluster in Streptomyces roseosporus by an autoregulator AtrAJournal of Biological Chemistry, 2015, 29012:7992–8001.

[4] Tan-Jun Wang, Yi-Ming Shan, Han Li, Wei-Wang DouXin-Hang Jiang, Xu-Ming MaoShui-Ping LiuWen-Jun Guan* and Yong-Quan Li*Multiple transporters are involved in natamycin efflux in Streptomyces chattanoogensis L10,Molecular Microbiology2017 103(4), 713–728

[5] Qing-Ting Bu, Pin Yu, Jue Wang, Zi-Yue Li, Xin-Ai Chen, Xu-Ming Mao* and Yong-Quan Li*Rational construction of genome-reduced and high-efficient industrial Streptomyces chassis based on multiple comparative genomic approachesMicrobial Cell Factories2019 18:16

[6] Kai Wang, Qing-Wei Zhao, Yi-Fan Liu, Chen-Fan Sun, Xin-Ai Chen, Richard Burchmore, Karl Burgess, Yong-Quan Li* and Xu-Ming Mao*Multi-layer controls of Cas9 activity coupled with ATP synthase over-expression for efficient genome editing in Streptomyces, Frontiers  in Bioengineering and Biotechnology2019,7:304.

[7] Pin Yu, Qing-Ting Bu, Yi-Li Tang, Xu-Ming Mao and Yong-Quan Li*Bidirectional Regulation of AdpAch in Controlling the Expression of scnRI and scnRII in the Natamycin Biosynthesis of Streptomyces chattanoogensis L10, Frontierst in Microbiology,2018, 9: 316.

[8] Jie-Jie Shen, Fu Chen, Xiao-Xuan Wang, Xiao-Fang Liu, Xin-Ai Chen, Xu-Ming Mao* and Yong-Quan Li*Substrate Specificity of Acyltransferase Domains for Efficient Transfer of Acyl Groups Frontier in Microbiology, 2018, 9: Article 1840.

[9] Peng-Hui Yuan, Ri-Cheng Zhou, Xuepeng Chen, Shuai Luo, Feng Wang, Xu-Ming Mao*,Yong-Quan Li*, DepR1, aTetR-family transcriptional regulator, positively regulates daptomycin production in an industrial producer Streptomyces roseosporusSW0702, Applied and Environmental Microbiology, 201682(6):1898-1905.

[10] Pin Yu, Shui-ping Liu, Qin-Ting Bu, Zhen-Xing Zhou, Zhen-Hong Zhu, Fang-Liang Huang , Yong-Quan Li*,  WblAch, a Pivotal Activator of Natamycin Biosynthesis and Morphological Differentiation in Streptomyces chattanoogensis L10, Is Positively Regulated by AdpAch, Applied and Environmental Microbiology, 2014,80(22):6879-6887. 

C. 主持的国家级重要项目(限6项)

[1] 李永泉,国家重点研发计划合成生物学重点专项,放线菌药物合成生物体系重构与系统优化,批准号2019YFA090054002020.01-2024.12,总经费2044万。

[2]李永泉,国家自然科学基金重点项目,达托霉素生物合成过程的时序调控机制,批准号317300022018.01-2022.12,直接经费286万。

[3] 李永泉,国家自然科学基重点国际合作项目,链霉菌隐性次级代谢基因簇激活的分子机制研究,批准号315201039012016.01-2020.12,经费282万。

[4] 李永泉,863计划合成生物技术重大专项课题,微生物药物的高效合成生物技术研究与应用,批准号:2012AA02A706 2012.11-2015.12,总经费925万。

[5] 李永泉,国家新药创制重大专项课题,抗多重耐药细菌达托霉素的新药开发,批准号:2011ZX09202-101-112011.01-2015.12,经费354万。

[6] 李永泉,国家新药创制重大专项课题,奥利万星抗生素合成生物学研究,批准号2017ZX09101003-006-0132017.06-2020.12,经费100万。

2.杨巍教授

教授、博导,浙江大学基础医学院副院长。

2008年获浙江大学神经生物学博士学位后,留校任教至今,2009-2011年获得英国皇家学会牛顿国际奖学金资助赴英国利兹大学进行学术访问,2011年晋升副教授,2014年获得国家留学基金委访问学者资助赴美国加州大学戴维斯分校学术交流, 2015年晋升教授。

目前担任Frontier Molecular Neuroscience编委。曾获得2007年度中国神经学会青年学术论坛一等奖等学术荣誉,2009年英国皇家学会牛顿国际奖学金(SBFT-Royal Society Incoming Fellowship),2015年度中国生理学会张锡钧基金优秀青年论文一等奖。2016年入选浙江省优秀科技工作者和浙江省151第二层次人才。担任中国生理学会理事,中国神经科学学会理事,浙江省神经科学学会秘书长,浙江省毒理学会副理事长,浙江省生物医学学会副理事长等学术兼职。

主要研究配体门控的非选择性阳离子通道(TRPM2通道,NMDA受体,TRPV1通道和TRPP3通道)的结构功能关系,以及它们在神经系统中的生理和病理功能,并针对这些靶点开发脑中风等神经系统疾病的治疗药物。近5年共主持6项国家级科研项目,2项省部级项目,总到款经费1401.80万元;此外发表学术论文30余篇,其中SCIEI收录30余篇;授权发明专利1项。

A.    研究内容

从事先导化合物活性筛选,药物成药性和药效评价,新药研发的药理学等相关工作。

B.    5年承担的与本项目密切相关的科研课题

[1] 国家科技重大专项-“重大新药创制”科技重大专项子课题,瞬时受体电位通道TRPM2通道特异性抑制剂用于治疗脑中风的新靶点确认及创新药物发现,2018ZX09711001-004-0052018.01.01-2020.12.31141.10万元,排1

[2] 国家自然科学面上基金,钙离子调控TRPM2激活门控的分子机制,318727962019.01.012022.12.3160万元,排1

[3] 科技部蛋白质重大研究计划,活细胞中探测蛋白质动态学的新技术新方法,2013CB910204 2013-2017633万元,排1

C.    5年取得的与本项目密切相关的代表性成果

[1] Jiang Q, Gao Y, Wang C, Tao RR, Wu Y, Zhan K, Liao MH, Lu N, Lu YM, Wilcox CS, Luo J, Jiang LH*, Yang W*, Han F*. Nitration of TRPM2 as a Molecular Switch Induces Autophagy during Brain Pericyte Injury. Antioxidants & Redox Signaling, 2017.

[2] Zhang H, Liu H, Luo X, Wang Y, Liu Y, Jin H, Liu Z, Yang W, Yu P*, Zhang L*, Zhang L.Design, synthesis and biological activities of 2, 3-dihydroquinazolin-4 (1H)-one derivatives as TRPM2 inhibitors. European Journal of Medicinal Chemistry, 2018.

[3] Yu P, Liu Z, Yu X, Ye P, Liu H, Xue X, Yang L, Li Z, Wu Y, Fang C, Zhao Y, Yang F, Luo J, Jiang L, Zhang L, Zhang L, Yang W*. Direct Gating of the TRPM2 Channel by cADPR via Specific Interactions with the ADPR Binding Pocket. Cell Reports, 2019.

3. 管文军教授

教授/博士生导师,2004年博士毕业于浙江大学,2016-2018年美国康奈尔大学访问学者。现任浙江大学药物生物技术研究所副所长,浙江省微生物生化与代谢工程重点实验室副主任,浙江省微生物学会理事/秘书长。长期从事微生物合成生物学和微生物制药技术研究,主要研究方向为:(1 高效微生物底盘细胞设计:通过对微生物细胞代谢途径的设计和优化,构建基于链霉菌、酵母的底盘细胞,异源高效合成小分子药物和表达医药用蛋白;(2)微生物耐药机制: 研究微生物对自身次级代谢产物的耐受机制,着重于转运蛋白的结构-功能、转运网络的应答调控机制研究,系统解析了那他霉素高效转运的分子机制及其完整的转运网络。近年来主持了科技部合成生物学重点专项子课题、科技部863项目子课题、国家自然科学基金面上项目、浙江省自然科学基金重点项目、浙江省科技计划重点项目等,授权国家发明专利6项,在PLoS GeneticsMol. Microbiol.Genome ResearchAppl. Environ. Microbiol.BBA-BiomembraneFMES Yeast Res.Biosens and Bioelectron.等领域主流杂志上 发表SCI论文40余篇,获得省部级以上一等奖、二等奖3项。

A.工作经历

2016.01- 至今        浙江大学药物生物技术研究所,教授/博导

2013.12-2015.12      浙江大学生命科学学院, 教授/博导

2005.12-2013.12      浙江大学生命科学学院, 副教授/硕导

2006.11-2008.10      美国康奈尔大学, 访问学者/新星计划资助

B.近年主持的国家级项目

[1]     国家重点研发计划合成生物学重点专项子课题,抗肿瘤、抗感染等重要活性天然产物的合成途径解析和异源表达,子课题主持,95万,2019.08-2024.08 

[2]     国家重点研发计划合成生物学重点专项子课题,放线菌药物合成生物体系的网络重构与系统优化,批准号2019YFA09005400,子课题主持,90万,2020.01-2024.12

[3]     科技创新特区项目新一代重组凝血酶基因工程表达体系设计和酶特性优化研究,主持,147万;2017.07-2019.07

[4]     863计划项目子项目,抗生素生产菌种的基因组删减优化,主持,75万;批准号:2012AA0234072012.11-2015.12

[5]     863计划重大项目子项目,血糖检测与胰岛素注射微系统,主持,156万;批准号:2011AA0404062011.01-2014.12

[6]     国家自然科学基金面上项目,酿酒酵母ABC转运蛋白Pdr5p影响细胞麦角甾醇平衡的分子机制研究,主持,56万;批准号:311700322012.01-2015.12

C.代表性论文

[1]     Han Li, Jiaxiu Wei, Jianxin Dong, Yudong Li, Yongquan Li, Yinghu Chen, Wenjun Guan* . Enhanced Triacylglycerol Metabolism Contributes to Efficient Oil Utilization and High Production of Salinomycin in Streptomyces albus ZD11. Applied and Environmental Microbiology. 2020,86(16): e00763-20

[2]     Yiming Shan, Dong Gou, Quanshu Gu, Yudong Li, Yongquan Li, Yinghu Chen*, Wenjun Guan*, Genome Mining and homologous comparison strategy for digging Exporters contributing Self-resistance in Natamycin-producing Streptomyces strains. Applied Microbiology and Technology. 2020, 104: 817-831

[3]     Tanjun Wang, Yiming Shan, Han Li, Weiwang Dou, Xinhang Jiang, Xuming Mao, Shuiping Liu, Wenjun Guan*, Yongquan Li*, Multiple transporters are involved in natamycin efflux in Streptomyces chattanoogensis L10.Molecular Microbiology. 2017103(4), 713–728

[4]     Weiwang Dou, Jianhua Zhu, Tanjun Wang, Wei Wang, Han Li, Xin Chen, Wenjun Guan*, Mutations of charged amino acids at the cytoplasmic end of transmembranehelix 2 affect transport activity of the budding yeast multidrug resistance protein Pdr5p. FEMS Yeast Research 2016, 16(4) : 1-11

[5]     Hui Jiang, Yue-Yue Wang, Xin-Xin Ran, Wei-Ming Fan, Xin-Hang Jiang, Wen-Jun Guan*, and Yong-Quan Li*. Improvement of Natamycin ProductionbyEngineering of Phosphopantetheinyl Transferases in Streptomyces chattanoogensis L10. Applied and Environmental Microbiology, 2013, 79: 3346-3354

4. 毛旭明教授

浙江大学药物生物技术研究所教授、博导,浙江省微生物制药技术工程实验室副主任,博士生导师。

1997年考入复旦大学生命科学学院进行本科学习,20075月在中国科学院上海生物化学与细胞生物学研究所获博士学位后到浙江大学任教至今。2015年底晋升教授。20135月至20155月到美国加州大学洛杉矶分校(UCLA)做访问学者2年。201910月至今兼任浙江省微生物学会理事。

一直从事合成生物学方面理论和实验研究工作,包括微生物制药、微生物天然产物的生物合成与调控机制等研究方向。近5年主持国家级科研项目5项,总到款经费256万;发表SCI论文40余篇;授权发明专利2项;获省部级技术发明奖一等奖1项。

A.    研究内容

从事微生物制药与微生物合成生物学研究,通过微生物药物的生物合成调控网络、合成途径的深入解析与系统重构,实现微生物药物的优质高产,建立基于合成生物学理念的活性天然产物深度挖掘、动物/植物源药物的微生物制造技术体系,培养理论与实践技术相结合的创新性人才,通过技术与产业紧密结合与互动,促进我国微生物制药技术升级,提升制药企业的国际竞争力,并加快团队建设,快速提升浙江大学药物合成生物学在我国乃至世界的影响力。

B.    5年承担的与本项目密切相关的科研课题

[1] 国家重点研发计划合成生物学专项子课题,非核糖体肽药物的精准合成与调控网络重构,批准号2019YFA09054002020.01-2024.12,总经费94万元,主持(排1)。

[2] 国家自然科学基金面上项目,单加氧酶可变剪切异构体在aurovertins及其结构类似物生物合成中的功能与催化机制,批准号317700712018.01-2021.12,经费71.8万元,主持(排1)。

[3] 国家重点研发计划课题,防腐剂抗氧化剂和配料绿色制造关键技术研究,批准号2016YFD04008052016.07-2020.12,经费134万元,主持(排1)。

C.    5年取得的与本项目密切相关的代表性成果

[1] 中国石油与化学工业联合会技术发明奖一等奖,放线菌药物高效生物合成关键技术及其产业应用,排32019125

[2] Wang K#, Zhao QW#, Liu YF#, Sun CF, Chen XA, Burchmore R, Burgess K, Li YQ*, Mao XM*. Multi-layer controls of Cas9 activity coupled with ATP synthase over-expression for efficient genome editing in Streptomyces. Front Bioeng Biotechnol. 2019. 7: 304.

[3] Guo YY, Li ZH, Xia TY, Du YL, Mao XM*, Li YQ*. Molecular mechanism of azoxy bond formation for azoxymycins biosynthesis. Nat Commun. 2019. 10: 4420.

5. 陈新教授

浙大药物生物技术研究所副所长、教授、博导,浙江大学-多伦多大学遗传与基因组医学研究所副所长。获得多项基金项目支持,获得教育部新世纪优秀人才荣誉。

2004年毕业于新加坡国立大学,历任新加坡国立大学生物系助理教员、蓝图计划亚洲研究所高通量数据部门主管、生物信息学系副主任等。

一直从事合成生物学方面的计算研究工作(包括分子结构模拟、进化分析、合成体系与发酵环境的互作建模);已发表论文40余篇,包括Gut, Plant Cell, Bioinformatics等知名期刊论文,他引1200余次。

A.    研究内容

承担合成生物学研究中的大数据分析工作,包括基因组、蛋白组、代谢组分析,合成体系与发酵环境的互作建模等,通过理论预测为实验研究提供可能的方向,高效优化人工合成体系。

B.    5年承担的与本项目密切相关的科研课题

[1] 国家自然科学基金面上项目,基因集功能关联分析:依据功能关联网络解析组学变化的整体生物学意义,315713562016-201966万元,主持

[2] 国家重点研发合成生物学重点专项子课题,放线菌药物合成生物体系重构与系统优化,2019YFA09054002016-201966万元,子课题主持

C.    5年取得的与本项目密切相关的代表性成果

[1] Hu, H., W. T. Wang, Z. X. Zhu, J. H. Zhu, D. Y. Tan, Z. P. Zhou, C. Z. Mao and X. Chen (2016). "GIPS: A Software Guide to Sequencing-Based Direct Gene Cloning in Forward Genetics Studies." Plant Physiology 170(4): 1929-1934.

[2] Shi, D. Y., J. M. Zhang, Q. Zhou, J. J. Xin, J. Jiang, L. Y. Jiang, T. Z. Wu, J. Li, W. C. Ding, J. Li, S. W. Sun, J. Z. Li, N. Zhou, L. Y. Zhang, L. F. Jin, S. R. Hao, P. C. Chen, H. C. Cao, M. D. Li, L. J. Li, X. Chen and J. Li (2017). "Quantitative evaluation of human bone mesenchymal stem cells rescuing fulminant hepatic failure in pigs."Gut 66(5): 955-964.

[3] Yao, H., X. Wang, P. Chen, L. Hai, K. Jin, L. Yao, C. Mao and X. Chen (2018). "Predicted Arabidopsis Interactome Resource and Gene Set Linkage Analysis: A Transcriptomic Analysis Resource." Plant Physiol 177(1): 422-433

6. 杜艺岭研究员

研究员、博导,浙江大学基础医学院/浙江大学药物生物技术研究所。2017年入选国家青年项目和浙江省特聘专家。

2002年考入浙大生物技术系学习,2011年获浙江大学生物化学与分子生物学博士学位,同年到加拿大英属哥伦比亚大学化学系做博士后和研究助理,20175月入职浙江大学。

一直从事合成生物学和化学生物学方面的理论和实践工作,近5年主持了国家自然科学基金面上项目和浙江省基金项目,并参与了国家合成生物学重大专项等项目。本人作为第一或通讯作者的研究论文发表在Nature子刊《Nature Chemical Biology》、美国科学院院刊《PNAS》和《ACS Synthetic Biology》的国际权威杂志上。

A.  研究内容

从事与微生物药物相关的化学生物学与合成生物学领域的基础理论研究与应用实践,研究领域主要包括:(1)微生物源药物及活性代谢产物的生物合成与调控机制解析;(2)新颖生物化学反应的发现及酶结构、功能与反应机理的研究;(3)基于合成生物学的药物高产优产与新活性分子的发现。在本项目中,将承担与课题组研究方向相关的药物生物合成机制解析和基于合成生物学技术的途径优化等研究。

B.  5年承担的与本项目密切相关的科研课题

[1] 青年项目,微生物化学生物学与合成生物学,2017.1-2019.12200万元

[2] 国家重点研发计划合成生物学重点专项子课题,2018YFA0903200,抗肿瘤、感染等活性天然产物合成途径解析及异源表达,2019.7-2024.687万元

[3] 国家自然科学基金委员会,面上项目,31872625,新颖氮氮键合成酶的酶学机理及应用研究,2019.1-2022.1262万元

C.  5年取得的与本项目密切相关的代表性成果

[1] Yi-Ling Du*, Melanie A Higgins, Guiyun Zhao, Katherine S Ryan* (2019) Convergent biosynthetic transformations to a bacterial specialized metabolite. Nature Chemical Biology, 15, 1043.

[2] Yi-Ling Du, Hai-Yan He, Melanie A Higgins, Katherine S Ryan* (2017) A heme-dependent enzyme forms the nitrogen-nitrogen bond in piperazte. Nature Chemical Biology, 13(8):836.

[3] Yi-Ling Du, Rahul Singh, Lona M Alkhalaf, Eugene Kuatsjah, Hai-Yan He, Lindsay D Eltis, Katherine S Ryan* (2016) A pyridoxal phosphate-dependent enzyme that oxidizes an unactivated carbon-carbon bond. Nature Chemical Biology, 12(3):194.